Hiện nay, dùng thuốc trị u nang buồng trứng và phẫu thuật là 2 phương pháp chính được sử dụng trong điều trị bệnh u nang buồng trứng. Mỗi phương pháp điều trị lại phù hợp với một nhóm đối tượng nhất định.